Για τη σχέση της κυβέρνησης με την Εκκλησία για το θέμα των θρησκευτικών ρωτήθηκε ο υφυπουργός Παιδείας κ. Μπαξεβανάκης που ανέφερε: «Η κυβέρνηση και το υπουργείο Παιδείας συνομιλεί με όλους. Όμως είμαστε υποχρεωμένοι να τονίζουμε διαρκώς πως οι ρόλοι του καθενός είναι διαφορετικοί. Το περιεχόμενο όλων των μαθημάτων που διδάσκονται στα σχολεία, καθορίζεται από το υπουργείο Παιδείας. Βεβαίως συζητάμε και με την Εκκλησία τι έχει να συνεισφέρει σε αυτόν τον τομέα, αλλά το τι διδάσκεται στα γενικά σχολεία είναι ευθύνη του Κράτους και όχι της Εκκλησίας».
Παράλληλα υπογράμμισε με νόημα πως «η σχέση της κυβέρνησης με την Εκκλησία είναι σε καλό επίπεδο και υπάρχει ένας εξαιρετικός διάλογος, ενώ το νέο πρόγραμμα σπουδών στα θρησκευτικά που διδάσκεται φέτος, θα αποτιμηθεί στο τέλος του διδακτικού έτους από μια κοινή επιτροπή. Θα ληφθούν υπόψη οι παρατηρήσεις, αλλά τις αποφάσεις τις λαμβάνει το Κράτος και όχι η Εκκλησία».